阿克蘇職業技術學院于2002年由原阿克蘇地區農業學校、衛生學校、農業機械學校、文化藝術學校、財貿學校、體育運動學校6所中專學校合并組建而成，是南疆（阿克蘇、喀什、和田、克州）地區唯一一所高等職業院校，目前學院在校生中來自南疆四地州的約為60%。經過10年以來的并校合院建設，學院取得快速發展，學院是教育部等國家六部委指定的西北五省唯一的護理專業技能型緊缺人才示范性培養培訓基地，2008年以優秀等次通過教育部高職高專人才培養工作水平評估，2011年被列入自治區第二批示范性高職院校建設計劃。辦學50余年來，學院培養各類人才40000余名，2002年合校以來，培養高職（大專）人才6000余名，目前每年向社會輸送各類技能型人才1500余人。據不完全統計，目前阿克蘇各鄉鎮、團場基層干部和技術人員中，約有60%左右畢業于學院，為地方和區域社會經濟發展做出了重要貢獻。

根據阿克蘇地區及南疆區域經濟社會發展要求，“十二五”期間學院發展思路是：立足阿克蘇，面向南疆三地州，服務新疆，重點服務地區“64122”工程（“64122”即：培植做強石油石化、煤電能源、煤化工鹽化工、鋼鐵冶煉和礦產開發、棉紡織、農林產品精深加工“六大支柱產業”，著力建設特色林果、優質商品棉、商品糧、畜禽產品生產“四大基地”，努力把阿克蘇建成充滿生機活力和吸引力的旅游及商貿物流集散地，進一步提升阿克蘇市、庫車縣兩座“龍頭城市”功能，著力彰顯龜茲、多浪“兩大文化品牌”影響力），建成“綜合辦學特色鮮明，區域服務特色突出”的高水平高等職業院校，不斷提高服務區域經濟社會發展能力，輻射帶動南疆區域職業教育整體發展，為南疆跨越式發展和長治久安做出更大貢獻。到2015年，規劃全日制在校生8000人，其中高職生6000人，中職生2000人，成人學歷教育2000人，各類培訓數量達到50000人次以上；在編教師達到650名，專任教師500名；高職專業達到50個，其中自治區級特色專業達到3個；力爭建成國家級精品課程2門，自治區級精品課程3門， 院級經課程30門；實驗實訓條件顯著提升，建立農林牧、工科化工、醫學技術、財貿技術、電子信息五大實驗實訓中心。

學院的建設發展，得到了各級領導的親切關懷和指導，中共中央政治局委員、原自治區黨委書記王樂泉同志、國務委員司馬義 艾買提同志、上海市委副書記王安順同志、河南省委副書記支樹平同志曾先后赴學院參觀考察、自治區領導侯長安、劉怡、黃昌元、王懷鈺、克尤木 巴吾東等也曾先后到學院視察工作。阿克蘇地區領導對學院的建設發展更是高度重視，地區主要領導經常到學院現場辦公，對學院的各項工作進行檢查、指導和部署，解決學院建設發展過程中遇到的困難和問題。

學院以“艱苦奮斗、勤儉辦學、教師為本、學生至上”為辦學思想。以“立足南疆，面向市場，服務地區經濟發展和社會進步，以就業為導向，突出少數民族高職教育特色，培養適應生產、建設、管理、服務第一線需要的用得上、留得住、下得去的應用型專門技術人才”為辦學定位。力爭通過5—10年的努力，把學院建成新疆一流、全國知名的高等職業技術院校，使學院成為南疆本土特色較強的高職教育研究中心；推廣新技術的生產力促進中心；專業技術人才的培養中心。為促進地區乃至整個南疆的經濟發展和社會進步提供強有力的人才、智力和技術支持。